E' successo così tante volte che penso sarebbe impossibile stilare una lista, servirebbe una enciclopedia, conta poi il fatto non secondario che fino a una quarantina di anni fa a Hollywood era quasi la norma che la produzione avesse l'ultima voce in capitolo rispetto ai registi. 
Comunque per citare uno dei casi più astrusi con risultati pessimi fu il rimontaggio di C'era una volta in America di Leone: uno dei distributori tagliò tantissimi minuti e rimontò il film in ordine cronologico snaturando completamente il film (che infatti in questa versione andò orrendamente e non lo vide nessuno)

Questa di C'era una volta in America è incredibile. Che tu sappia c'è un modo per reperire questa versione?

Nell'epoca d'oro degli studios molti registi non erano nemmeno accreditati come autori, a favore invece degli studios che possedevano opera e il suo realizzarsi: per questo ci sono tantissimi esempi come risposta alla tua domanda; un caso esemplare è quello di Von Stroheim, se ti può interessare

Io credo che magari meno rispetto una vota ma ancora adesso i produttori tendano ad avere l'ultima parola

Se sei davvero sicuro di volerla vedere, quella versione.....

Preda troppo facile, sarebbe mancato il divertimento della molestia -.-